Die Nähe zu tödlichen Viren, die sich im Sicherheitsbereich des FLI befinden, machte nachdenklich. Es gibt aber auch das Gefühl von Sicherheit, dass es dieses wichtige Institut mit seinen Spezialisten gibt.
Im Mittelpunkt der Arbeiten des Friedrich-Loeffler-Instituts (FLI) stehen die Gesundheit und das Wohlbefinden lebensmittelliefernder Tiere von der Honigbiene bis zum Rind sowie der Schutz des Menschen vor Zoonosen, d. h. zwischen Tier und Mensch übertragbaren Infektionen. Diese Aufgaben sind im Tiergesundheitsgesetz festgelegt. Das FLI arbeitet in verschiedenen Fachdisziplinen sowohl grundlagen- als auch praxisorientiert und verfolgt verschiedene Ziele. Neben den  Schutz vor Infektionskrankheiten, Tierseuchen und Zoonosen durch
eine bessere und schnellere Diagnose, die Erarbeitung von Maßnahmen zur Prävention und der Schaffung von Grundlagen für moderne Bekämpfungsstrategien, geht es auch um die Verbesserung des Wohlbefindens landwirtschaftlicher Nutztiere und Erzeugung qualitativ hochwertiger Lebensmittel tierischer Herkunft.